Le nouvel outil COI Tool de WGI Software réunit en un seul instrument les évaluations génétiques validées (consanguinité et index de sélection) pour planifier les accouplements. Une fois la lice, l'étalon et le numéro de générations sélectionnés, l'outil restitue ces valeurs :
Linebreeding (5–7 gén.)
La "consanguinité récente", produite par les ancêtres qui se répètent dans les dernières générations : ceux qui ont la plus forte probabilité de transmettre aux chiots, de manière positive ou négative, des caractéristiques précises. Il ne quantifie pas la consanguinité réelle car il s'agit d'une valeur partielle, dénuée de correspondance et de proportionnalité au niveau de l'ADN (Dreger et al., 2016).
COI TOT (all gen.)
La "consanguinité totale", calculée sur toutes les générations jusqu'aux fondateurs de la race. Elle correspond à la consanguinité mesurable sur l'ADN (F-ROH) et bénéficie donc d'une validation scientifique (Caniglia et al., 2018). Rapportée à la moyenne de la race, elle indique concrètement si l'accouplement produit une consanguinité élevée, modérée ou faible, et c'est le paramètre qui permet de contenir, génération après génération, les effets les plus insidieux de la consanguinité.
AVK 5/10
Coefficient de perte d'ancêtres, calculé à deux profondeurs : 5 et 10 générations. Il mesure à quel point le pedigree est riche en ancêtres divers et uniques — une valeur de 100 % indique que tous les ancêtres de la fenêtre considérée sont uniques ; plus la valeur est élevée, plus la diversité génétique de l'accouplement est grande.
AVK5 évalue la diversité dans les générations les plus récentes. AVK10, calculé selon la même logique mais à une profondeur double, sert au contraire à repérer les goulots d'étranglement génétiques plus en amont, au-delà de ce que laissent voir les dernières générations : dans notre race, ses valeurs sont nettement plus basses que celles d'AVK5, ce qui en fait l'indicateur le plus utile pour évaluer l'impact sur les générations futures.
Percentiles (AVK)
Un percentile indique la position d'une valeur par rapport à un groupe de référence : se situer au 70e percentile signifie faire mieux que 70 % des cas comparés. Nous l'utilisons pour les AVK parce qu'une valeur "bonne" aujourd'hui pourrait ne plus l'être dans quelques années, à mesure que la population de la race évolue — comparer l'accouplement simulé aux chiots nés ces dernières années, plutôt qu'à un seuil fixe, donne une lecture toujours actualisée et cohérente dans le temps.
Balance score
Un score unique, allant de -100 à +100, qui combine en un seul chiffre le percentile d'AVK10 et celui du COI pour le même accouplement. Une valeur positive indique un équilibre globalement favorable entre diversité génétique et consanguinité par rapport aux chiots nés récemment ; une valeur négative signale que, dans l'ensemble, la balance penche du côté défavorable — même lorsque l'un des deux indicateurs pris isolément semble correct. Il ne remplace pas les indicateurs AVK5/AVK10, il les complète par une lecture d'ensemble.
Pedigree Index (HD, NBA, A, XK)
La valeur génétique moyenne attendue pour les chiots sur quatre caractères. Le zéro représente la moyenne de la race : les valeurs positives indiquent un potentiel d'amélioration, tandis que les négatives indiquent un potentiel de détérioration. L'amplitude de l'échelle varie d'un caractère à l'autre :
- HD dysplasie de la hanche : de -40 à +20
- NBA prolificité des lices : de -30 à +35
- A taille, comme hauteur au garrot : de -35 à +45
- Xk robustesse de la structure osseuse : de -30 à +50
Accuracy
Indique la fiabilité des index. Dans les accouplements simulés, les index agissent comme des Pedigree Indexes (index de pedigree), calculés à partir des données phénotypiques des parents, ancêtres et collatéraux ; un Pedigree Index peut atteindre une précision maximale de 60 %. Le seuil opérationnel minimum est de 30 % : en dessous de ce seuil, les index doivent être interprétés avec prudence et considérés comme une estimation approximative. La précision dépend de l'héritabilité du caractère (plus elle est élevée, plus il est facile d'obtenir une précision élevée), de la quantité de données phénotypiques utilisées dans le calcul (le nombre affiché à droite de chaque index) et de la proportion de ces données qui concernent des parents proches des parents choisis. Si les ancêtres des parents ont peu de données phénotypiques, la précision sera faible ; si elles en ont beaucoup, elle sera élevée.
Remarque concernant les chiens nés à des époques passées
Si vous simulez un accouplement en utilisant des chiens nés il y a de nombreuses années, il est probable que les percentiles AVK, le Balance score et les EBV ressortent défavorables ou négatifs. Cela ne signifie pas qu'il s'agissait d'un mauvais accouplement : ces indicateurs comparent toujours le résultat à la population de référence actuelle (les chiots nés récemment), et non à la population de l'époque à laquelle ces chiens sont réellement nés et ont été accouplés. La race ayant évolué au fil du temps — davantage d'ancêtres uniques disponibles aujourd'hui, mais aussi davantage apparentés entre eux — un même accouplement peut se lire de façon très différente selon la population à laquelle on le compare.